常用的滅菌方法可分為物理的和化學的兩類,即：物理方法如干熱（烘燒和灼燒）、濕熱（常壓或高壓蒸煮）、射線處理（紫外線、超聲波、微波）、過濾、清洗和大量無菌水沖洗等措施；化學方法是使用升汞、甲醛、過氧化氫、高錳酸鉀、來蘇水、漂白粉、次氯酸鈉、抗菌素、酒精化學藥品處理.這些方法和藥劑要根據工作中的不同材料不同目的適當選用.
　　培養基在制備后的24小時內完成滅菌工序.高壓滅菌的原理是：在密閉的蒸鍋內,其中的蒸汽不能外溢,壓力不斷上升,使水的沸點不斷提高,從而鍋內溫度也隨之增加.在0.1MPa的壓力下,鍋內溫度達121℃.在此蒸汽溫度下,可以很快殺死各種細菌及其高度耐熱的芽孢.
　　注意完全排除鍋內空氣,使鍋內全部是水蒸氣,滅菌才能徹底.高壓滅菌放氣有幾種不同的做法,但目的都是要排凈空氣,使鍋內均勻升溫,保證滅菌徹底.常用方法是：關閉放氣閥,通電后,待壓力上升到0.05MPa時,打開放氣閥,放出空氣,待壓力表指針歸零后,再關閉放氣閥.
　　關閥再通電后,壓力表上升達到0.1MPa時,開始計時,維持壓力0.1-0.15MPa,20分鐘.
　　到達保壓時間后,即可切斷電源,在壓力到0.5MPa,可緩慢放出蒸汽,應注意不要使壓力降低太快,以致引起激烈的減壓沸騰,使容器中的液體四溢.當壓力降到零后,才能開蓋,取出培養基,擺在平臺上,以待冷凝.不可久不放氣,引起培養基成分變化,以至培養基無法擺斜面.一旦放置過久,由于鍋爐內有負壓,蓋子打不開,只要將放氣閥打開,大氣壓入,內外壓力平衡,蓋子便易打開了.

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