菌種是食用菌生產的基礎，只有優良的菌種才可能有好的收成。菌種一般分為母種、原種或栽培種3級。 無論制作哪一級菌種，關鍵應強調無菌觀念，嚴格按照無菌技術要求進行操作。
　　
　　 一、母種、原種、栽培種的制作過程
　　
　　 1．母種：
　　
　　 母種也就是一級菌種，它的制作大致經過以下幾個過程：培養基配制--→培養基滅菌--→子實體分離或菇木分離或孢子分離--→培養--→轉管純化培養--→母種。
　　
　　 ①母種培養基配制。應根據不同食用菌的不同營養需要配制不同的培養基。常用的配方有：配方1：土豆葡萄糖瓊脂培養基(簡稱pda培養基)：土豆(即馬鈴薯)200g、葡萄糖20g、瓊脂(凝固劑)20g：配方2：土豆蔗糖瓊脂培養基(psa培養基)：土豆200g、瓊脂20g、水1000ml、蔗糖20g；配方3：土豆胡蘿卜瓊脂培養基(pca培養基) ：土豆20g、胡蘿卜25g、瓊脂20g、水1000ml：配方4：土豆瓊脂培養基(pa培養基)：土豆250--00g、瓊脂20g、水1000ml。
　　
　　 ②母種分離。即通常將食用菌的子實體、土壤中的菌根、菌素分離或進行菇木分離或擔孢子分離，然后在培養基上培養，得到母種。
　　
　　 ③母種擴大培養。用上述方法得到的母種數量有限，往往不能滿足生產上的需要，因而需要通過接種來擴繁一批母種供生產用。 苗木網,www.cqhuayin.com
　　
　　 2．原種：
　　
　　 原種也叫二級菌種，是由母種接種到瓶子或塑料袋里，經培養后得到的菌種。制作原種的目的，一是為了擴大種量，滿足生產上的需要；二是讓菌絲對各種秸稈類物質具有適應能力，并在適應的同時產生各種酶類；三是在培養過程中還可以對菌種的生命力、純度等進行檢驗，存優棄劣。通過接種，一支母種可擴接3--5瓶原種。現簡要介紹幾種原種培養基配方：
　　
　　 ①鋸末培養基：鋸末(闊葉樹) 78％、米糖(或麥麩)20％、糖(紅糖或白糖，下同)1％、石膏粉1％，水適量；
　　 ②棉子殼培養基：棉子殼78％、麥麩或米糠20％、石膏粉1％、糖1％，水適量；
　　 ③鋸末玉米粉培養基；鋸末(闊葉樹) 90％、玉米粉8％、糖1％、石膏粉1％，水適量；
　　 ④稻草段培養基：稻草段78％、米糠或麩皮20％、石膏粉1％、糖1％；
　　 ⑤鋸末、棉子殼混合培養基：鋸末40％、棉子殼40％、麥麩18％、石膏粉1％、糖1％，水適量；
　　 ⑥酒糟培養基：干酒糟40％、棉子殼(或鋸末)40％、麥麩18％、石灰1％、糖1％，水適量。
　　
　　 3．栽培種：
　　
　　 栽培種是直接用于生產栽培的菌種，也叫三級菌種或生產種。栽培種比原種的需要量更大，所用的培養基配方和制作方法與原種相同，將發滿瓶的原種，接種到栽培種瓶子或薄膜袋里即可得到栽培種。一般每瓶原種可擴接60--100瓶栽培種。

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