袋栽平菇在發菌期，通常存在袋內發菌速度不一致、發菌期過長、污染率高、出菇期菌墻稍高易倒、采收二茬菇后菌袋失水嚴重補水困難等問題，嚴重影響產量和品質。近年來在生產上研究成功了平菇微孔發菌、滲灌出菇新技術，有效解決了上述問題。
    微孔發菌。培養料的選擇、配料、拌料、發酵等同常規，不同點是在裝袋前用縫紉機在菌筒上面扎三層針眼，作為菌絲生長期供應空氣的微孔通道�；蛟诔Ｒ幯b袋后，待菌絲萌發時用針在菌種層處扎眼。
    滲灌出菇。菌絲發滿袋后，用刀子縱向做三個長方形的口子，每個口子寬5～8厘米、長20～25厘米，在做口子時刀子不要傷害菌絲。然后將做好口子的出菇袋移到出菇場所，一層袋子一層泥堆碼菇袋，高度以1.5米為限，最上層泥要厚些，并做好水溝。堆積出菇袋前，先用磚壘個底盤，防止出菇時濺上泥沙等雜物。此法的原理是利用泥的傳水性和保水性作為供給菌袋出菇失水而補水的“蓄水池”，利用菌袋上的口子，將泥中的水滲灌到菇袋中。在出菇時水溝要灌滿水，采菇后每天灌水1～2次，其它管理同常規。 采用微孔發菌、滲灌出菇法，能使平菇發菌期提前10～15天，污染率降低5～10倍，菌絲生長同步，菌齡一致，出菇整齊，易于管理。菌袋出過兩潮菇后也不用浸泡補水，既防止了由于浸泡而損失培養料的養分，又減輕了勞動強度，提高了產量和品質。