根腐病　　先由須根、支根變褐腐爛，逐漸向主根蔓延，最后導致全根腐爛，直至地上莖葉自下向上枯萎、全株枯死。該病常與地下線蟲、根螨的為害有關，在土壤黏度重、田間積水過多時發病嚴重。黃芩、丹參、板藍根、黃芪、太子參、芍藥和黨參等中藥材易感染此病。防治方法是：在播前用殺蟲藥防治地下害蟲，同時增施腐熟有機肥，以增強抗病力。發病初期可用甲基托布津、多菌靈等800-1000倍液灌根，雨后及時排水。 

　　根結線蟲病　　由于根結線蟲的寄生，在藥材根部長了許多瘤狀物，致使植株生長緩慢、葉片發黃，最后全株死亡，受此病為害的藥材有丹參、桔梗、黃芪、人參和北沙參等。防治時最好與禾本科作物輪作或水旱輪作，播前用甲基異柳磷處理土壤。 

　　白絹病　　常發生在近地面的根處或莖基部，出現一層白色絹絲狀物，嚴重時腐爛成亂麻狀，最終導致葉片枯萎、全株死亡。常在高濕季節或土壤漬水條件下發病。受此病為害的藥材主要有黃芪、桔梗、白術、太子參和北沙參等。防治時應與禾本科作物輪作或水旱輪作，播前土壤用石灰消毒或用多菌靈、甲基托布津液浸種消毒。 

　　立枯病　　最初是幼苗莖基部出現褐斑，進而擴展成繞莖病斑，病斑處失水干縮，致使幼苗成片枯死。受此病為害的藥材主要有黃芪、杜仲、人參、三七、白術、北沙參、防風和菊花等。處理方法有：降低土壤濕度，及時拔除病株，并用多菌靈、五氯硝基苯等處理土壤，噴藥預防其他健株感染。