番木瓜花葉病毒病是近年來番木瓜產地普遍發生的毀滅性病害。植株一種下后就會發病，葉片上出現斑駁型黃色花點，新葉密集緊束，迅速失綠并變硬脆，易折斷，其后不發新根，不長新葉，植株越長越小，并逐漸枯萎死亡。感病植株無法開花結瓜，產量低，品質差，必須采取綜合措施進行防治：
     在番木瓜幼苗定植成活后，根部淋施一次1000倍硫酸鋅、600倍植物病毒疫苗混合液，每株淋1～1.5公斤左右，以削弱番木瓜植株體內的病毒活性，能明顯減輕番木瓜花葉病毒病的發生和危害。在番木瓜植株生長發育過程中，必須每15～20天葉面噴灑一次600倍植物病毒疫苗、1500倍神農素螯合肥、1000倍硫酸鋅混合液，或800倍病毒必克，1000倍壯豐優、1000倍硫酸鋅混合液，均勻噴濕所有的葉片，以開始有水珠往下滴為宜，可防治番木瓜花葉病毒病的發生和危害。
     另外，要注意防治傳播花葉病毒病的昆蟲如蚜蟲、蚧殼蟲和白粉虱。在番木瓜生長發育過程中，注意檢查莖葉，發現有上述害蟲發生危害時，及時連續噴灑2～3次1000倍蚜虱凈水溶液，或1500倍蚧虱凈水溶液，或1000倍樂斯本水溶液進行防治，每7～10天噴灑一次，均勻噴濕所有的莖葉，以開始有水珠往下滴為宜，即能殺死上述害蟲，避免傳播花葉病毒病。