（1）真菌病害真菌性病害是花卉病害中最主要的一類。真菌是沒有葉綠素的低等植物，肉眼看不見。它不能自造養分，以菌絲體在花卉體內吸收養料。真菌孢子借風、雨、昆蟲等四處傳播。常見花卉真菌性病害有：
　　白粉病：病菌附生在芽蕾和嫩葉上，出現白色霉層，被害葉和梢卷曲萎縮、畸形，花蕾不能正常開放，病菌孢子隨氣流傳播蔓延，晝夜溫差在10℃時最易大面積發作，溫室內最易蔓延。如月季、倒掛金鐘、梅花、鳳仙花、瓜葉菊、大麗花白粉病等。
　　黑斑病：為花卉常見病害，病害在土壤中潛伏，隨雨水濺落侵入下部葉片，迅速向上蔓延。被害葉片先出現黑色斑點，逐漸擴大成圓形、橢圓形接連成片。病葉萎黃、凋落，對花卉生長影響大。通常在7--8月雨季發病較迅猛。常見的有月季、菊花、牡丹、天竺葵黑斑病等。
　　黑銹病：病菌孢子侵染，開始葉片正面出現蒼白色小斑點，逐漸膨大呈稍圓形突起，背面表皮破裂生出橙黃色粉末，隨風飛散，大面積侵染。隨后，在葉片上生暗墨色橢圓斑點，葉背表皮破裂后，又生出黑色粉末。嚴重時，自下而上全株染病，葉片焦枯，提早脫落。常見的有玫瑰、鳶尾、薔薇黑銹病等。
　　幼苗立枯病：由鐮刀菌、絲核菌和腐霉引起的幼苗病害，表現癥狀為腐爛、猝倒、立枯等，以幼苗出土20天內受害最重。常見的有唐菖蒲、百合、海棠、香石竹立枯病等。 999中國苗木網,www.cqhuayin.com
　　炭疽病：主要為害葉片，也可為害莖部。一種是在葉片上，長出淡褐色或灰白色而邊緣則呈紫褐色或暗褐色的近圓形斑點。此斑點常發生于葉緣或葉尖，其上有黑色小點，即病菌分生孢子盤。嚴重時使大半葉片枯黑。如蘭草炭疽病，也常見于白蘭、橡皮樹、仙客來、繡球等花卉上；另一種是在莖上產生圓形或近圓形的病斑，呈淡褐色，其上生黑色小點。如仙人掌類炭疽病，霉雨季節或秋雨連綿時，為類嚴重。防治法：平日要注意盆花的透光和通風，不要放置過密。少量葉片受害時，可剪除病葉燒毀，嚴重時可噴射50%多菌靈可濕性粉劑500—花齊放1000倍溶液，或50%托布津可濕性粉劑500倍溶液，有較好的防治效果。
　　煤煙病：為害多種花木的枝葉和果實。病原為多種真菌。它們多以蚜蟲或介殼蟲作為傳播的媒介。初期時表面出現暗褐色霉斑，逐漸擴大形成黑色煤煙狀霉層，阻礙植株的光合作用，使植株無法制造養分而枯萎死亡。防治法：應首先防治蚜蟲和介殼蟲；如已發生煤煙病，夏季可用波美0.3度石硫合劑，冬季用3度、春季用1度的石硫合劑防治；也可用上例中的多菌靈、托布津防治。
　　此外，還有根腐病、葉斑病等。
　　（2）細菌病害細菌是一種很小的單細胞生物，沒有營養體和繁殖的分化，通過細胞膜攝取養分，以分裂方式進行繁殖。細菌侵染主要通過氣孔、密腺、傷口等途徑，一般借流水、風雨、昆蟲、土壤以及病株殘余體等來傳播。常見的細菌病害有月季、榆葉梅的根癌病和柑橘的潰瘍病等。