蓮瓣蘭與其它的蘭花一樣，因管理不當會發生各種病蟲害。病蟲害一旦發生加上防治不及時，對蘭花的生長危害相當嚴重，影響蘭葉的觀賞價值。蓮瓣蘭蟲害不算太多，但是還要注意防治措施，主要常見的有以下幾種：
        介殼蟲。介殼蟲有多種，有黃介、粉介、紅介和黑點介等。介殼蟲靠有吸盤吸附于蘭葉上，吸食葉綠素為生，是一種極為頑固又易發生的害蟲。發生介殼蟲害之后，即使將它消滅，也給綠色的蘭葉留下白點和黃點，嚴重時一片蘭葉特別的是葉根部全變成白黃相間的殘痕，加上蘭是一次性長成，永遠也不能恢復原狀。介殼蟲滋生的原因一是盆上水份過重，再是養植地點不通風或是通風不夠。
        紅蜘蛛。紅蜘蛛是一種軟體小動物。它主要是依靠吸食葉綠素生存，蓮瓣蘭一經被侵襲，整個葉面漸漸地喪失葉綠素，出現小白點，嚴重地破壞蘭株生長。這種害蟲繁殖力強，一發生就成群地集結在葉的背面或葉輛部，吸食養份。紅蜘蛛產生的原因是盆土過于干燥和通風很差。
        薊馬。薊馬也是一種危害蘭葉的害蟲。它們也是從蘭葉表皮組織中吸食養料，使葉面留下終身不能恢復的小白點。這種害蟲產生的原因是蘭株原來感染，栽培的地方不通風。

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