灰霉病    該病在田間大量發生時，往往造成葉枯，最后導致植株枯死。在高濕情況下，葉背病斑部可見灰色霉狀物，為病原菌的分生孢子。

　　防治百合灰霉病的關鍵是注意通風，不能密植，宜采用滴灌方式供水。在容易發病的季節，因連續使用單一藥劑可能導致病原菌發生抗藥性，故可用對口藥劑輪流使用，每隔7～10天噴施1次。

　　疫病    該病可造成百合莖部、花器枯萎腐敗及全株萎凋死亡。

　　防治百合疫病的關鍵是避免連作，筑高畦以利排水。發病時切勿溝畦灌溉，發病初期可用防治疫病的藥劑輪流使用，每隔7～10天1次。

　　莖腐病    該病主要是由鐮孢菌為害種球、鱗片及莖部造成的，當百合種球及鱗片受害后，植株生長矮化且葉片呈現淡綠色。

　　由于本病害為土傳播性真菌病害，可采用與水稻輪作的方式進行防治。亦可將土壤經淹水兩個月及曝曬后再行種植，以避免鐮孢菌危害。同時可用對口殺菌藥及時防治，每7天噴霧1次。

　　青霉病    該病主要是在貯藏期間危害鱗莖、葉、莖。貯藏期間，在鱗片腐爛斑點上首先長出白點，然后會長出絨毛狀的綠蘭色的真菌。

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