萱草的主要病害是銹病、葉斑病和葉枯病；蟲害是蚜蟲、蝸牛、金龜子和紅蜘蛛。
　　1.病害防治   銹病、葉斑病和葉枯病是萱草極易發生的病害。銹病為真菌性病害，是萱草中后期的主要病害，5月上旬開始發生，六七月最為嚴重，直到10月以后才逐漸停止，危害葉片、花苔。葉片最初產生少量黃色粉狀斑點，后逐漸擴展到全葉，以致全株枯死。發病時可噴施25%的粉銹寧可濕性粉劑200倍液或65%的代森鋅500倍噴霧防治。葉斑病由鐮孢霉屬真菌引起，是萱草苗期的主要病害，3月底至4月初開始發病，4月中下句至5月中下旬是發病高峰。可噴灑波爾多液或石硫合劑進行防治。葉枯病由刺盤孢屬病原真菌引起，是繼葉斑病后發生的苗期病害。一般5月上旬開始發病，6月上中旬最為嚴重，主要危害葉片，也危害花苔。從幼苗時便發病，葉片中部邊緣初產生水漬狀小點以后逐漸向上下蔓延，形成褐色條斑，最后至灰白色，嚴重時全葉枯死。可用50%多菌靈600倍至800倍液噴灑或代森鋅可濕性粉劑600倍液噴灑，也可在清明前后噴施波爾多液來防治。
　　2.蟲害防治萱草的主要蟲害是紅蜘蛛、印度修尾蚜和蝸牛。
　　對于印度修尾蚜，防治方法為：鏟除雜草，剪除殘枝敗葉，特別是有蟲的葉片；黃色薄型塑料板粘蟲板誘殺有翅蚜；注意保護天敵，如瓢蟲、草蛉等。天敵數量多時，盡量少用廣譜性農藥，選用適合的生物農藥，如使用1.2%苦煙乳油800倍至1000倍液噴霧；發生量大時要及時噴藥，可用2.5%敵殺死2500倍至3000倍液，6%吡蟲啉3000倍至4000倍液等其中一種進行葉面噴霧，噴時注意安全。

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